Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMB3Q9NPA1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms