Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms