Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC52A2Q9HAB3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC52A2Q9HAB3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms