Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN2Q9H4D0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms