Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX5Q9H2C1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX5Q9H2C1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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