Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD4Q9H223 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms