Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms