Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms