Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PACSIN1Q9BY11 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms