Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD2Q9BSE4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms