Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms