Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YME1L1Q96TA2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms