Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms