Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms