Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM47Q96LD4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms