Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG3Q96JB2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG3Q96JB2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms