Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM46AQ96IP4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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