Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF183Q96D59 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF183Q96D59 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF183Q96D59 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF183Q96D59 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF183Q96D59 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF183Q96D59 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF183Q96D59 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF183Q96D59 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF183Q96D59 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF183Q96D59 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF183Q96D59 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF183Q96D59 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF183Q96D59 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms