Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4CQ96CF2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms