Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms