Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms