Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNRQ92752 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNRQ92752 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNRQ92752 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNRQ92752 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNRQ92752 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNRQ92752 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
TNRQ92752 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
TNRQ92752 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNRQ92752 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
TNRQ92752 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRQ92752 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRQ92752 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRQ92752 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRQ92752 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRQ92752 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRQ92752 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNRQ92752 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TNRQ92752 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRQ92752 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRQ92752 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRQ92752 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRQ92752 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRQ92752 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRQ92752 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNRQ92752 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNRQ92752 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms