Protein–RNA interactions for Protein: Q92673

SORL1, Sortilin-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORL1Q92673 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORL1Q92673 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORL1Q92673 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms