Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC107Q8WV48 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC107Q8WV48 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms