Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms