Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms