Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms