Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBP1Q86WP2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms