Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PBRM1Q86U86 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms