Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APTXQ7Z2E3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms