Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC129Q6ZRS4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms