Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE3Q6ZMZ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE3Q6ZMZ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms