Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC41PQ6P2S7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms