Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP5Q6NZY7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms