Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms