Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC38Q502W7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms