Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS9Q3SYG4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms