Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP41Q3LFD5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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