Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETM2Q2VYF4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms