Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms