Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC27Q2M243 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms