Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NTRK3Q16288 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms