Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK4Q16099 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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