Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS72Q15906 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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