Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL19A1Q14993 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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COL19A1Q14993 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL19A1Q14993 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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COL19A1Q14993 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL19A1Q14993 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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