Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC1AQ14683 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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