Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL4AQ13619 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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