Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRSQ13332 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms