Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX3Q13185 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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