Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLFQ13129 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLFQ13129 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RLFQ13129 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RLFQ13129 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RLFQ13129 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RLFQ13129 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLFQ13129 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms